对于帝国为什么在之前太多的战争中取得那么严重的败仗，阿莱克修斯对此有着自己的看法，但是这样的看法并不被认可，直到自己开始统领军队，阿莱克修斯才深刻的发现自己的看法还是太过于浅薄了。
首先是吃空饷的问题，这个是非常困难的问题，基本上大部分军队会发生的情况，阿莱克修斯决定从安排宗教人士下基层来处置这个问题，这些宗教人士在军队担任文书和命令的监督的工作，其中最重要的就是核实军队实际人数。
一般50人的上尉部队会安排一名六等牧师参与其中，100人的百夫长则会安排一名五等教士外加三名六等牧师参与文书工作，而军事统领安排一名四等教长外加三名五等教士和九名牧师参与基础的工作，而针对千户则暂时没有安排，毕竟目前只有格林和“教士”担任千户，完全没有必要派出宗教人士来管理，再加上“教士”是最高宗教领袖，根本没有办法用宗教人士监管，干脆不在安排。
这是阿莱克修斯的想法，当然这个想法被“教士”非常严厉的批评了，老人认为制度是不能有先例的，一旦出现就会被后人效仿，必须严肃杜绝。
阿莱克修斯不得不接受老人的建议，派出一名三等司祭外加三名四等教长和九名五等教士参与到千户的军士工作中，当然格林对于这个建议非常赞同，甚至对“教士”的建议大家赞同，当然阿莱克修斯可以作证，格林肯定不是被威逼的，而是已经被揍了一顿，顶着两个熊猫眼，才能说出这样高尚的话语。
除了在军事制度上进行改革之外，阿莱克修斯研究发现军队之所以会士气低落，主要是有两方面的因素，一是军饷没有按时发放，二是军功奖励没有到位，这些都是让士兵士气低落的主要原因。
阿莱克修斯总结了现在军队薪金发现，这些士兵都是按照西部军区最低一等发放薪金的，也就是每两个月获得一枚金币，但是阿莱克修斯一直在军功奖励方面不小气，所以到现在所有人都没有士气低落的不满，但是这也只是时间的问题。
毕竟阿莱克修斯现在基本都是全职士兵，很少征召那些农兵，但是守城的士兵与野战士兵的薪金是一样的也是非常不妙的事情。
骑兵和步兵的薪金也是一致的，这也是个问题，很显然这些问题都应该被解决。
阿莱克修斯决定将军队分成三个等级，每个等级的士兵的薪金都不同，这样可以做到起到激励的作用。
阿莱克修斯认为任何野战的军队都应该是第一等的无论是步兵还是骑兵，所以第一等的士兵每个月应该领取4枚金币，军士则是每个月应该领取18枚金币，夫长则可以在每个月领取80枚金币，上尉则可以在每个月领取220枚金币，百夫长则可以在每个月领取510枚金币，军事统领则可以在每个月领取1050枚金币，千户则可以在每个月领取2200枚金币，将军则可以在每个月领取4500枚金币。
第二等的士兵则是守城的卫队，只要是全职士兵都是这个等级的，第二等的士兵每个月应该领取2枚金币，军士则是每个月应该领取12枚金币，夫长则可以在每个月领取72枚金币，上尉则可以在每个月领取150枚金币，百夫长则可以在每个月领取310枚金币，军事统领则可以在每个月领取630枚金币，千户则可以在每个月领取1300枚金币，将军则可以在每个月领取2700枚金币。
第三等的士兵则是被征召的民兵和那些基本没有任何培训的新兵，他们只要在战争期间就应该获得薪金，第三等的士兵每个月应该领取1枚金币，军士则是每个月应该领取6枚金币，夫长则可以在每个月领取36枚金币，上尉则可以在每个月领取108枚金币，百夫长则可以在每个月领取188枚金币，军事统领则可以在每个月领取400枚金币，民兵部队不设千户和将军，因为完全没有必要，一般民兵部队的夫长可以由第二等军队的军士担任，上尉可以由第二等军队的夫长担任，百夫长可以由第二等军队的上尉担任，军事统领可以由第二等军队的百夫长担任。
阿莱克修斯基本上将第一线的军队的薪金提高了四倍，但是也将原来6500人的军队缩减至2500人。
阿莱克修斯规定重骑兵为兵种第一等应该领双薪，弓骑兵和斥候第二等应该领1.5薪，轻骑兵和重装全甲刀手为第三等应该领1.2薪，骑马民兵、骑兵侍从、重步兵射手为第四等应该领标准薪金，轻装步兵、弓箭手、标枪兵都是第五等应该领取薪金的八成。
所以阿莱克修斯每个月需要支付2500磅黄金的金币，作为野战部队和守卫部队的薪金。
也就是阿莱克修斯草创期间，连连收获多次大胜，柯布亚克部落、亚速部落、阿明的库班金库、以及罗姆人苏丹的赎金的一半、还有自己的祖父安德洛尼克斯·科穆宁以及他的儿子们留下的黄金全部在阿莱克修斯手中，才让敢以一个士兵的四倍发放薪金。
但是对于士气的提升也是非常有效的，对于现在的野战的部队来说，就是遇见苏丹的王族亲卫他们也敢狠狠地撕下一块肉，更不要说其他军队了。