零号坐着直升机追捕金刚狼罗根，他杀死了帮助金刚狼罗根的两个善良的老人。无论大卫班纳吕牧不管怎么努力，也改变不了人心！若是在基地里，有人这样滥杀无辜，那他一定会被大卫折磨的怀疑人生，可是在他看不见的地方，人的本质暴露无遗。愤怒的金刚狼发誓要为两位老人报仇。他不死的身躯根本就不可能被普通的子弹杀死！当零号想要乘坐直升飞机逃走的时候，金刚狼骑着摩托车，跳到空中，用他那锋利的艾德曼合金利爪直接斩碎了直升飞机的螺旋桨！坠毁的直升飞机里，史崔克上校正在试图联系奄奄一息的零号，金刚狼抢过对讲机，他告诉史崔克，他会杀上门去找他报仇！……金刚狼找到鬼魂约翰和弗雷德，正好布莱德利也在这里，几个人诉说这些年的遭遇。最早离开基地的是布莱德利，然后鬼魂约翰因为反感和愧疚帮助史崔克抓捕变种人的行为，他也离开了基地。弗雷德当时也一起跟着鬼魂约翰走了，弗雷德和零号关系很好，他知道一些基地里的内幕和八卦。比如，基地要造出一个集合所有变种人能力的超级怪物！史崔克上校最怕大卫中校！任何人都不可以伤害变种人！要表现的慈善才不会受到折磨。“大卫是谁？”金刚狼罗根问道。“就是六年前在非洲的那个最厉害的变种人！”鬼魂约翰说道。“大卫是我哥们！”吕牧在一旁插话道。“想起来了，我在基地里见过他！”金刚狼罗根想起了之前大卫班纳吕牧安慰他的样子。“他们把所有的变种人都关押在一个小岛上面。小岛的具体位置我不知道，但是有叫雷米的一个变种人从那里逃出来了！找到他就能找到小岛！雷米经常出现在波旁大街的赌场里。”弗雷德说道。“干嘛这么费劲！我问问我兄弟大卫不就得了！”吕牧一脸你们这么笨的表情说道。“喂？大卫，我们什么时候去你那里？什么？还没有好？还需要什么？斯考特已经被带回基地了，还需要约翰的基因！我已经取得了！嗯！嗯嗯！我会交给他的！”吕牧用电话和大卫班纳吕牧通话。“走吧！咱们还得去找雷米！”吕牧耸肩说道。几个人看着不靠谱的吕牧一阵无语。鬼魂约翰和金刚狼骑着摩托车，吕牧开车拉着布莱德利，他们来到波旁大街上的夜场。吕牧让所有人进去找雷米，他按照小威震天吕牧定位维克多的位置在后门找到他。“维克多！这是鬼魂约翰的血液样本！”吕牧从角落里将一个小瓶递给维克多。“你是谁？”维克多接过小瓶，他的另一只手已经长出了利爪！“我是大卫中校的兄弟，你不是想要进行基因改造吗？我只要跟他说一声，史崔克都得听他的！”吕牧拿出电话递给维克多。“维克多，你干的很好！我会劝说史崔克，下一个改造的人就是你！让你也获得那些人的能力！现在赶快带着血液样本回基地！”大卫班纳吕牧在电话那头忽悠着剑齿虎维克多。维克多满意的离开了，当吕牧回到夜场里面的时候，雷米已经被金刚狼和鬼魂约翰制服。经过几人拳头的劝说，雷米终于同意带着几人进入关押变种人的小岛。……三天后，小岛基地内。一群科研人员正在给死侍注入各种变种基因。“大卫这两天怎么没有看到他的人？这不像是他的性格呀！”史崔克上校不解地对他的美女助手说道。“大卫中校上次说要去执行秘密任务，然后他就自己离开了！”“他对于x武器基因改造知道多少？”史崔克上校问道。“大卫中校了解几乎全部的基因提取工程，而且有许多的变种基因的融合，是由他带队破解的！他对于基因方面的知识，可以说非常的渊博！”美女研究员如实汇报。“那控制程序呢？”史崔克问道了关键之处。“这方面大卫中校不曾接触。我们利用变种基因，在x—11号身体中植入了变种生物导体，由基地里的超级电脑控制！不过……”美女研究员欲言又止。“不过什么？”史崔克上校问道。“昨天，电脑的服务器突然间多了个镜像硬盘，所有的文件都被镜像复制了！后来又有不到两分钟的断电时间，等到系统重启，一切又恢复了正常。”美女研究员说道。“这个系统从来都不与外界相连，即使内部网络也从来不使用！任何黑客都不可能攻击进来！而且我们设计的控制程序一直就没有装入硬盘，它一直在x—11的身上。只有等到激活x—11终极兵器，才会把它连接电脑里面。现在，让技术人员格式化所有的硬盘，我们重新安装系统，我就不信还有人能够黑进这样的电脑！”史崔克命令道。……雷米开着飞机，带着几人来到小岛上空，金刚狼跳了下去，吕牧几人寻找降落地点。金刚狼罗根潜入基地，他终于找到了史崔克。“罗根！欢迎回到战场！”“在我掏出你的肠子之前，我想知道为什么？”金刚狼愤怒的说道。“我需要你的力量！”史崔克看着正在注入变种基因的x—11终极兵器说道。“为了什么？变种人杀手吗？”“是的！一个死侍！经过这么多年的研究和提纯，我终于找到了合适的方法，将所有的力量集中在一个身体里，而不会消散！我的儿子是这个谜题的第一环，而罗根你是最后一环！是你让x—11号武器成为了可能！我找你帮忙，但你却说想要平静的生活。好吧！我听说最能触动你的只有复仇，那么我就把它送给你！”史崔克带来了罗根死去的女朋友凯拉。凯拉并没有死，她只不过是被注射了抑制心跳的药物，然后在她的身上撒上鲜血，制造出一个死亡的现场。凯拉也是变种人，她的能力是只要她接触的人，她就能够对其进行催眠。史崔克利用她的能力让金刚狼完全爱上她，好控制金刚狼的意志。可是银狐凯拉却从未对罗根用过自己的能力，她们是真心相爱！如果不是凯拉的妹妹也被史崔克抓住，她才不会为史崔克对付自己的爱人的！