如果明初坚定的对蒙元清算，就绝不会有今日之局面。承认元朝，就是承认异族对中国有合法占领，就是承认那些为蒙元效力的汉族官僚不是汉奸，同时也是承认明兴元亡是正常的改朝换代。那么，儒家思想熏陶的汉族读书人就可以心安理得的再次接受另一个异族入侵，从而在心理上得到安定，理直气壮的做汉奸。
国可亡，教不可亡，便是儒教两千年来立身之基，立身之论。
廖瑞祥奏疏上说了很多，周士相从中看到了对于儒家思想的批判，虽然廖并没有完全提出民族主义这一概念，但显然，他已经摸到了门槛，但离内在还有很大差距，毕竟，廖仍是这个时代的传统文人，并非如同周士相一般接受了民族国家观点的后世人。
但廖瑞祥做为这个时代的传统文人，能够看到这一点，已然是极其难得。有明一代，可从来没有一个人敢于置疑《元史》的正统性，敢于否定蒙元。从这方面来说，廖是第一人。
时代塑造一个人，也塑造人的思想。周士相相信，廖瑞祥敢于提出蒙元非中国论，要求重修《元史》，完全是甲申以来中国之乱对他的影响。
为什么会出现今天的局面，为什么那些士绅蜂涌降清，争先剃发？原因还不是因为明朝承认了元朝，所以清朝这个异族同样也可以是正统王朝。
不过廖的观点有着很大的时代局限性，诸如将明初修元史，承认元朝为中国正统王朝完全归咎于那些亲近蒙元，或在蒙元治下享受好处的文官们，而不是太祖皇帝。
如果朱元璋不答应，凭开国之君和他那雷厉风行的手段，周士相不以为宋濂等主修《元史》的官员敢承认元朝，这件事，归根结底还是权谋手段的体现，或者说是儒家思想的一种体现。
这种儒家思想就是典型的驼鸟思想，没有办法反抗，就把头埋起来，装作什么都没有听到，没有看到。只要这个外来者承认儒教，继续尊孔，那万千儒教的读书人就当它是自己人。
等到了满清入关，这个思想便再次有了用武之地。
也许，朱元璋自己也没有认识到官方修元史，祭祀忽必烈等蒙古人会有怎样的遗毒，他也许是单纯的想用这个手段拉拢北方的士绅，也可能是真的认为自己顺应天命，也可能他真的是被那万千读书人迷惑住了。这就是时代的缺陷，身处儒家思想“繁盛”的时代，哪怕是开国之君都不能从儒家影响中挣脱出来，反而要拉拢、重用儒教。
朱元璋，再雄武大略，也是封建统治者。
他给各国的诏书，给臣民的诏书都称蒙元是胡人，异族，很可能是秉性而为，照心里想法直说。但官方却承认蒙元，修《元史》，在周士相看来，却更多的是这位草根皇帝没有将修史当作一回事。《元史》331天修成，恐怕也正是这位开国皇帝内心真实想法的写照。然而他不当一回事，儒教却当一回事，那些谁强奉谁的士绅地主们当一回事。
重修元史，是廖瑞祥理解的可以肃清思想的最好办法，他简单的将今日中国之局面和《元史》联系起来，他的观点周士相总结了一下，就是蒙元非中国，或者说元清非中国。
蒙元肯定不是中国，这一点无庸置疑。元朝是由蒙古这个野蛮民族所创立，从创立之初，元朝就不曾将汉人当过他们的子民，而是视汉人为亡国之人。他们肆意屠杀、掠夺，无恶不作，完全视自己为汉人的征服者。这种政权，也就是那些儒家读书人能厚颜无耻的称其为中国，换作那些被压迫的老百姓，就纯碎是去他娘个逼了。
满清和蒙元不是相象，而是一模一样，都是压迫奴役汉族百姓，拉拢汉族读书人。而读书人是汉族的天然精英，他们掌握着所有的资源，掌握着话语权，由着这些人去修史，后果自然是极尽赞美异族，否则，他们何以安身立命。
然，对于百姓而言，却是苦了。一小部分人有屠杀大部分人的特权，有奴役大部分人的特权，自家的读书人却美其名曰统一大王朝，百姓们何想，何做。
元末，成千上万的汉人聚集在黄河边上，发出了华夏沉沦百年的最强音。现在，成千上万的汉人聚集在周士相麾下，同样发出了复仇的声音。
不论前者，还是后者，都不是读书人，而是他们视之为蝼蚁的百姓。
周士相哪怕做皇帝，他也绝不会做封建时代的皇帝，所以他和朱元璋不同，他决定重修《元史》，彻底否认蒙元。不但重修《元史》，更要将忽必烈从帝王庙中迁出，将木华黎那帮蒙古人也从祭祀历代名臣的庙中迁出。除此以外，他决定要大张旗鼓的宣传蒙元非中国论、满清非中国论，以此来否定儒教，否定满州。
只有让天下人知道蒙元和满清并非中国，那么接下来的问题就简单明了。那些继续替满清效命的汉族士绅，要么回到中国怀抱，要么顶着汉奸的名声死去。
至于前世所谓否定元清，就等于是将蒙古、东北、新疆、西藏等地分离出去，在周士相看来完全是个笑话。这些地方，在历史上从来不属于哪个民族，更不是哪个政权的私产。元、清固然统治过这些地方，可中国的汉、唐、明同样也统治过这些地方。凭什么认为元清非中国，就等于承认这些地方不是中国的呢？
蒙元也好，满清也好，都是汉人的亡国史。历史已经发生，事实不容改变，那我们就当勇敢承认，而不是不敢面对，不以此为耻，反以此为荣。
失败不可怕，被征服不可怕，可怕的是我们的文明被中断，我们的传承被打断。可怕的是面对征服者的屠刀，我们的读书人却在那高声赞颂。
失去的，我们要自己夺回。
周士相一时难忍心中情绪，提笔回复廖瑞祥，让他即日进京，主持重修《元史》。随后，他以大都督的名义，命扬州、江阴、福州、广州、赣州、南昌、太仓等曾经被清军屠城地方，调查死于清军屠杀的遇难者姓名，统一成册，立碑立馆纪念。
南都，亲军也接到命令，“组织”六部大小九卿衙门官员前往各地参观清军暴行。《扬州十日记》等记载清军暴行的书籍、小册也被大量从民间收集，由官方统一加印出版，成为各级学堂学子必读书籍。