阿古柏在北疆一败涂地后，再也没有实力控制南疆，南疆本来就脆弱的平衡一下就被打散。
原来被迫臣服于阿古柏的各族，相继起来反抗他的统治。阿古柏一回到南疆，便陷入跟各族反抗大军的争斗之中。
树倒猢狲散，墙倒众人推。
阿古柏在新疆造孽太多，当初制定了各种名目繁多的税赋，不断的从百姓手里搜刮者财富。为了维护他的统治，还制定了相当严苛的律法教条。百姓们稍有违背他的统治，便被残忍的虐待致死。
原来他有白彦虎数十万的洋枪兵，又有马占鳌的数十万骑兵，大家才不甘心的臣服于他。
现在他身边总共数千多人马，谁也没再把他放在眼里，纷纷带着族人起来报仇雪恨。
英国和俄国也对他失望之极，害怕投给他的军火打了水漂，也就断了对他的支持。
两国也不是傻子，本来支持阿古柏是想在新疆分的一点利益。但是现在新疆眼看着就要被华兴军平定，谁也不敢再做赔本的买卖。
阿古柏在众叛亲离中，终究是没有再折腾起半点风浪。他为之信赖的洋人也抛弃了他，一夜间就击垮了他生存的信念。
回到南疆一个月后，阿古柏在一片喊杀声中走到生命的最后尽头，落魄的服毒自杀。对于新疆人来说，他始终都是一个侵略者，一个不属于新疆人的暴君。
乔志清穿越前的历史上，左宗棠平定北疆之后，阿古柏也就是在这种情况下服毒自杀。有些人终究逃脱不了自己的宿命，不管历史发生了怎样的变化。
此时马占鳌刚刚绕过吐鲁番，带着七万的残兵败将进入了南疆。
本来他想继续投靠阿古柏，在他那里弄些物资补给。但是大军刚进入焉耆县，就听闻了阿古柏的死讯。
马占鳌郁闷的要死，大骂这个老东西没有骨气，这么轻易的就自杀了。
焉耆县是回人的聚居区，回人在南疆也就这么一个大的聚居区，人数不过三十多万人。
马占鳌便想在这个地方东山再起，重新再拉起一支兵马。
他在鄯善县屠杀维族人消息，早就被阿不力孜通告给了北疆和南疆的维族各部落。
维族人现在和回族势不两立，北疆因为华兴军的压制，大家暂时还井水不犯河水。但是南疆现在正处于混乱之中，阿古柏死后，两族的矛盾终于激化，纷纷拉起队伍各自争斗了起来。
南疆还有一个巴音郭楞蒙古聚居地，也被卷入了这场争斗之中。
蒙古人和回人在元朝时就是相互合作的关系，当初回族人在蒙古铁骑横扫亚欧的时候可是立了大功。蒙古人在中原建立元朝之后，回族人可是仅次于蒙古族的第二等人。
现在回族和维族争斗，蒙古人自然站在回族的一边，成为马占鳌的盟友。
维族人虽然人数上占优势，但是回族人和蒙古人的战斗力却强悍，都是清一色的骑兵。
双方战斗了好几次，都是维族人大败而归。焉耆县也成为了回族人的避风港，其他各地的回人各部为了避免维族的屠杀，全都吵着焉耆县迁徙了过来。
焉耆县一夜之间，回人的数量暴增，仅仅过了一个月，便突破了五十万人。
更让马占鳌欣喜的是，宁夏的回族也经过了千难万险，举族迁徙到了焉耆县。
比起新疆的回族，马占鳌和宁夏的回族自然更为亲密一些。
当初陕甘宁的回族本就是一家，一起举兵反清，一起屠戮的汉人。
本来马占鳌在甘肃被华兴军打的走投无路，进了新疆归顺了阿古柏后，还想联合白彦虎推翻阿古柏自立。
但是白彦虎却甘心当了阿古柏的走狗，处处在阿古柏的跟前为难马占鳌。
马占鳌后来也不再将情面，在阿古柏的面前找机会就挑拨离间，最后终于让阿古柏下决心除掉了白彦虎。
如今宁夏回人一来，马占鳌更是如虎添翼。
宁夏回人现在完全归马耀邦统领，从宁夏逃出的回人多大五十来万。为了避开河西走廊上的华兴军，他们日夜兼程的选择在荒凉的戈壁滩和沙漠上赶路。
这一路下来，不知道有多少的老弱病残被杀害吞噬，最后只有一般人走了出来。