还训练过海军，防备倭寇。
甚至，去国子监考核过国子师生的学业。
朱元璋还让他陪伴在朱允炆左右，以培养感情。
可以说，他就是老朱留给朱允炆的班底之一。
徐允恭也没有愧对老朱对他的信任。
朱允炆要削藩时，他力主将朱棣的三个嫡子，扣押在应天。
即便这个三个孩子是他的亲外甥。
可惜黄子澄反对，朱允炆就将三个人质全放走了。
然后朱棣就反了。
建文三年，李景隆大败损兵十余万，他为全军断后，完美完成任务。
建文四年，在朝廷无将可用的情况下，他临危受命披甲上阵。
在齐眉山数次击败燕军，斩杀朱棣旗下大将数人。
适逢盛夏酷暑难当，燕军久攻不利逐渐势颓，建文军扭转局势的机会似乎就在眼前。
然后，历史上演绎过无数次的经典桥段来了。
有人进谗言，说徐允恭乃燕王朱棣的大舅子，所以不肯尽力作战，否则燕军早就败了。
于是朱允炆以‘燕军已败，京师不可无良将防守’为由，一纸诏令将其召回。
燕军兵临长江畔，徐允恭以手中仅有的水师，数次击败燕军水师。
使燕军无法渡江。
然而朱允炆根本就不信任他，将水师交给了大将盛庸。
盛庸再次用实际行动，证明了朱允炆的愚蠢。
没多久就遭遇大败，将水师全部送给了朱棣。
朱棣由此渡过长江天险，顺利拿下应天。
在这种情况下，徐允恭依然拒不投降。
朱棣念及他是徐皇后的亲弟弟，只是削去他的爵位，勒令在家中禁足。
但他的爵位，依然由他的儿子继承，并传承了下来。
徐允恭的表现，可以说允文允武，水战陆战皆通。