有的读者老爷好像没看过时拉比的剧场版，所以有点看不懂前面的剧情，我可以简单概括一下。
以下内容包含剧场版的剧透，已经看过，或者是想自己看的读者老爷不要再往下看了哦。
剧场版的主角之一名叫雪成，也就是大木博士小时候。
某天他来到一座森林写生，在森林的入口遇到了少女“永久”。
永久给了雪成“如果你听到了森林的声音，就不能乱走动”的忠告。
雪成表示这都不是事，然后走进了森林。
结果他就在森林里听到了这道声音，还遇到了被猎人追捕的时拉比。
为了保护时拉比，雪成被“穿梭时空的力量”卷入，带到了40年后的未来。
在40年后的世界，雪成认识了小智一行人，并且通过将时拉比放入生命之湖，使其恢复健康的方式获得了时拉比的信任。
但是在这世界里，号称火箭队最强干部的面具比夏斯正打算捕猎时拉比。
比夏斯拥有能将一切宝可梦变得凶恶的黑暗球，将时拉比从小智他们的身边夺走。
为了拯救被比夏斯捕捉的时拉比，小智与雪成拼命奋战，最终让时拉比摆脱了黑暗球的控制。
然而时拉比因为黑暗球的暴走变得极度的虚弱，又因为生命之湖被污染了，所以即使再次将时拉比放入湖水中，也依旧没能恢复。
小智一行人想起某位不愿意透露姓名的神兽之耻可以净化湖水。
水君也适时地出现了，生命之湖的湖水恢复了正常，只是时拉比受到了太多的伤害，即使是生命之湖也不能治愈时拉比。
就在小智等人和森林里的宝可梦伤心哭泣时，“森林的声音”再次显现。
许多的时拉比出现在了生命之湖的上空，它们恢复了这只时拉比的生命。
危险结束后，雪成和小智不舍地告别，与时拉比共同回到了40年前。