此时后金大军在牧马场虎视眈眈，京城东北的府县几乎全部失守，袁崇焕多次被召入宫中商议对策。
袁崇焕心中也是苦闷，宣府总兵侯世禄的军队不堪一击，大同总兵满桂又受伤，身边可以信赖的将领只有祖大寿一人，而且他也认为在城外与明军对抗后金绝非对手。
于是袁崇焕又一次犯了糊涂，一再向皇帝建议让他带兵入城，等待后金大军攻城。
要说他的这个策略是正确的，这时候在城外与后金交战不过是自寻死路，虽然也能给后金造成一定的损失，但大明的损失更大。
可是袁崇焕不在乎非议，年轻的皇帝面子却挂不住了，他本就立志复兴大明，对袁崇焕解决辽东问题给予了极大的支持和信任，但后金这一巴掌实在打得太重。
大明虽然也曾被蒙古军队打到过京城，但在皇帝被俘的情况下，于谦还是组织军队将蒙古军队挡了回去。
现在敌人又一次打进了家门，但他所信任并大力支持的袁崇焕不但不主动去驱逐敌人，反而要求躲进京城任由后金军队肆虐京城周边。
但最关键的还是除了辽东事务，皇帝三次对袁崇焕的建议不予理会。
在元年，帝命削减蓟州的多余兵力以节军资，袁督师急书劝止，帝却未予理睬。
裁军之际，帝未虑及兵士后路，仅行裁减，未顾安置，致蓟州两度生乱。
继而帝又命停喀喇沁古蒙之赏赐，喀喇沁各部素赖此数十万银两购粮安民，亦因此未大举侵扰大明，赏赐维系了喀喇沁古蒙与大明的盟友关系。
袁督师闻讯返京，力劝帝勿停赏赐，终被帝所忽视。
至九月，后金集结兵力，袁督师警蓟州及朝廷，求增兵蓟州，命蓟州巡抚严防，却再遭朝廷与蓟州巡抚忽视。
十月，黄台吉出兵，袁督师遣四千精兵至遵化，欲入城助防，被蓟州巡抚王元雅拒之，援兵被迫退回。
此时，王元雅已自尽于蓟州衙门，且有消息证实后金之破口实为喀喇沁古蒙所引至大安口。
蓟镇虽拥兵十万，然各城多自行开城降敌。
种种迹象似皆证袁督师之见，帝之决策有误，然帝岂能有误？既帝无误，错必在他。
内阁大学士温体仁、兵部尚书梁廷栋屡上书劾袁崇焕之消极抗敌。