萧云就这么带着人加入了NERV，而且在NERV的整个地下基地之中被分配给了一个独立的区域。
NERV的地下基地远要比想象中的更大，基地也并非只有那个金字塔一样的建筑，昏昏沉沉的下世界里哪怕有阳光的引入看上去极为明媚，但在这样的一个空间中还是会让人有种压抑的感觉。
萧云被分配到的驻扎生活区域位于地下湖畔的附近，环境很好的一栋八层楼房，名义上属于NERV但萧云却知道碇源堂摆明了就是把这地方丢给他随便怎么搞，只要他能做到未经允许不进入金字塔一样的总部就好。
至于初号机则是被收了回去，那核心被初号机吃下也让初号机像是陷入了某种休眠再无反应，不过就以萧云最后得到的信息来看初号机在吃下了核心之后得到了很大的好处，只要使用得当就算不插电源也能够保持长时间的行动，就是那小鸡翅膀萧云没搞明白是个什么情况。
至于初号机的身体里自生出来的灵魂就是个傻子，白得跟一张白纸一样除了拥有本能之外其他什么都没有，弱小乏力除了瞎吼吼之外啥也不能做，碇唯的灵魂也差不了多少一样也只剩下了本能，被初号机自体影响得很严重而且同样很脆弱，而且因为被初号机这样的使徒之躯影响太久已经很不正常了。
说来也正常，要是碇唯的灵魂真要很强大那还要什么驾驶员，碇唯自己都能操作初号机这个躯体来对付使徒了，何至于只有碇真嗣遇见危险的时候初号机才能暴走而且还是那种疯狂的状况，现在搞明白初号机的身体内拥有两个灵魂也就能说得通。
碇唯的灵魂仅是想要保护碇真嗣，而初号机自己的灵魂才是那种疯狂的原始兽性吞噬和破坏一切。
不过现在这两个灵魂的情况远要比以前更糟糕，当然对于萧云来说那肯定是好的，因为两个灵魂已经被萧云的GEASS赋予了特殊的印记。
萧云住进NERV安排的楼房之后一连好些天碇源堂也没问过，刚住进这个大楼的时候萧云他们就对大楼彻底的检查过一次，找出了里面那些乱七八糟的监视器全部丢在外面，然后碇源堂也没出现在萧云面前过，完全就是不管不问，但入职该有的东西也还是有的，每天也都有人会过来给萧云他们这群人送东西。
碇源堂不希望萧云他们过去那边更多接触到初号机，也不愿意让萧云了解更多有关于NERV的情况，却根本无法阻止萧云会派人天天过去，早就把NERV基地主建筑的情况乃至于整个地下空间的情况搞得一清二楚。
而且3号等人回来还告诉萧云基地那边的地板正在大幅度改造，各个走廊也在进行改造，似乎是在地面上安装重力感应装置，在墙壁上增加某种探测系统，初号机现在也天天都被检查着，后面的小鸡翅膀差点就被摘了，要不是初号机忽然出声怒吼一副随时暴走的样子镇住了NERV不然那对好不容易长出来的小鸡翅膀就真没了。
对此萧云也不得不对碇源堂比个大拇指，这想法是真的妙啊，不过全都是白搭。
甭管装什么只要是前端产物那就一定有控制系统，反馈系统等等东西，不处理这些装置直接从终端控制一切，以NERV的防火墙技术还无法做到阻止他们的侵入，进进出出都这么多次了基地的主电脑早就被植入了量子病毒，不过NERV的电脑倒也有点意思，是一个由三部分所组成的人格模拟电脑，是一种将人类思维逻辑和模式植入的电脑系统。
不过在量子病毒和更高等级的科技面前依然没有任何抵抗之力。
每天萧云住的地方都有人来来往往，送这样送那样只要是萧云这边提出的需求都会尽量满足，但谁都知道这不过只是随时注意萧云他们行动的一种方式而已，但依然也没机会确认除了萧云之外其他人的容貌，特别是零伊，零尔，零珊这三个异族女战士，极少有摘下头盔并且被其他人看见的机会。
除了这三个之外还有外面的零姒，零舞，五个名字是萧云起的，12345简单明了，她们五个和正常人类有着很大的不同，而且容貌艳丽不能轻易见人不然很容易出现问题。
碇源堂不知道在想什么，不过萧云也乐于接受这种暂时的和平，反正他什么也不担心只要使徒出现而绫波丽那个三无少女无法解决那迟早有求到他这里的时候。
萧云也尝试过开门，那回馈简直是毫无反应，别说像是2号世界那样出现给出一个小小的反应那简直就是什么都没有，就像是萧云在对着空气挥手一样连点波澜都没出现。