而就在小智他们说话的时候，荣格博士突然被凭空出现的一只化石翼龙给抓了起来，向着屋后飞去。
“荣格！”大木博士看到后，一边向前跑，一边向荣格博士伸出手，想要救下荣格博士。
“爷爷！”不过跑了没几步后，突然再次出现了一只化石翼龙，把大木博士也给捉了起来，小茂喊道。
“喷火龙！喷射火焰！”小智当然不会让大木博士就这样被捉走，喷火龙嘴里喷出一道蓝色的火焰，向着空中的化石翼龙冲去。
“什么？”不过突然在弹道飞行轨迹上，出现了一只怪力，硬生生的用身体挡住了喷射火焰，接着就化为了一堆数据，消失了，幻影的主谋者也趁着这个时候离开了。
“小茂，我们上，要赶快救出大木博士，喷火龙，龙舞！”看到镰刀盔和多刺菊石兽向着喷火龙而来，小智立刻让喷火龙用剑舞强化。
“水箭龟，剑舞！”小茂那边也选择了强化，“水之尾！”刚强化结束后，就一击水之尾抽飞了一只太古盔甲，被抽飞的太古盔甲在空中化为了一堆数据。
“龙爪！”小智这边也不慢，喷火龙一个加速冲到镰刀盔和多刺菊石兽身旁，龙爪使出，直接打散了这两个数据。
“厉害。”小茂说道。
“你也不赖！”小智和小茂背靠背，说道。
“喷火龙，龙尾！”说话的时候，一只怪力冲了过来，喷火龙一个神龙摆尾就把它打散了。
“比比？”小茂说道。
“求之不得！”小智也是满满的战意。
“爆炸燃烧！”
“水炮！”
被两人的神奇宝贝轰炸的全场已经打扫的差不多了。
“哟！看样子我赢了呢！”小茂说道。
“喏，早着呢，那边还有三只，你也不过是多打了一只而已。”小智撇了撇一个方向，还有三只。
“这是怎么回事？”不过突然这三只幻影神奇宝贝自己解散了，变为了数据，向着研究所内而去，小茂看到后，不明所以。
“大家小心！”而这时刚刚被捉走的大木博士带着一只梦幻向这边跑了过来。
“大木博士，你没事吧？”小智看到大木博士后立刻问到。
“嗯，不过……”大木博士表示自己没事，随后看向研究所。
“哈哈哈……”
“幻影的主谋者？怎么会是荣格博士？”随着一声怪笑，幻影的主谋者再次的出现了，不过这次没有带面具，居然是荣格博士，而他的身旁也有一只神奇宝贝，小茂看到后不解的说。
“是超梦，怎么会？”随后小茂看到那只神奇宝贝则是大吃一惊。
“不，它不是超梦，是幻影系统所制造出来的。”小智一看就知道是怎么回事。
“没错，这是幻影超梦，是最强的神奇宝贝！”幻影的主谋者说道。
“爷爷，这到底是怎么回事，还有这只梦幻？”小茂发现一切都超过了自己的认知，所以问一旁的大木，而后大木博士就向大家解释了，原来一开始的幻影主谋者只是幻影，想要大木研究所的研究数据，大木博士不给，不过突然出现了这只不同寻常的幻影梦幻，幻影的主谋者非常的痛恨这只梦幻，说是失败品，就从这里大木博士推断出了这个幻影主谋者是荣格，不过荣格用这只幻影梦幻胁迫大木博士最后把研究数据交了出来，而这些数据中不乏小智告诉大木博士的关于传说中的神奇宝贝的数据，荣格把所有的数据整合，制造出了眼前的这只幻影超梦，是对当年神奇宝贝联盟把他踢出神奇宝贝学界的报复。
“居然会是这样！”大家了解到事情的真相后，都非常的吃惊。
“我要让你们看看我的理论是多么的完美无缺，还有小智，居然说我的幻影神奇宝贝只是堆砌的数据，那就让你看到它的实力！”随后荣格博士就操纵着幻影超梦向这边攻了过来，两发铁尾就把水箭龟给打败了，喷火龙也是被打了个半残。